Fiecare sistem de osmoză inversă va fi poluat și necesită curățare. Deoarece nu există de obicei un singur poluant atunci când are loc poluarea, procesul tipic de curățare include de obicei două etape: curățarea cu pH scăzut și curățarea cu pH ridicat.
Diferiții poluanți trebuie curățați cu diferiți agenți de curățare. Curățarea alcalină este folosită în principal pentru îndepărtarea microorganismelor sau a poluanților organici, iar curățarea acidă este folosită în principal pentru îndepărtarea depunerilor. Agentul de curățare trebuie selectat în funcție de tipul de poluanți și tipul de membrană pentru a evita deteriorarea membranei.
Secvența de utilizare a agenților de curățare trebuie determinată în funcție de problemele reale. Secvența obișnuită de curățare este spălarea cu acid mai întâi și apoi spălarea alcalină.
În unele cazuri, dacă poluarea este în principal materie organică sau microorganisme, poate fi efectuată mai întâi spălarea cu alcalii, urmată de spălarea cu acid și apoi spălarea cu alcalii.
Motivul important pentru a lua spălarea alcalină ca ultimă etapă este că poate deschide complet porii membranei după decapare, astfel încât să restabilească fluxul de producție de apă.
